ТС, прежде чем людям вопросы задавать, давайте полные вводные.
Был корпус под мех с маятником 35-37см, и был мех с маятником 42см и частотой колебания 104,5.
Ввиду того что новый маятник был слишком длинный, Вы его укоротили до 39 см, максимум который уместился в корпус, тем самым увеличили частоту колебаний и мех стал убегать на 2-3 минуты в час.
В Вашем случае изменение длинны и жёсткости пенделя ни коим образом не повлияют на изменение частоты колебаний в механизме, тем более в таких пределах, какие требуются в Вашем случае.
Изменение центра тяжести в линзе маятника диаметром 8 см, так же будет недостаточно. Да и увеличение массы маятника от расчётной, только увеличит износ механизма и может негативно повлиять на ход .
Если у Вашей леройки дверца имеет значительный запас в районе полуарки, можно переставить мех выше, увеличить длину маятника до расчётной , а накладку полуарки урезать.
В результате Вы увеличите длину маятника на 1.5-2 см и 1-1.5 см добавится от переделки линзы изменением её центра тяжести в нижнюю часть, при этом массу линзы постарайтесь оставить без изменения.
Как правило линза состоит из набора стальных дисков, заключённых в латунный корпус из тонкой фольги.
Сделав задник линзы из тонкой жести и наполнив её дробью Вы сместите центр тяжести и сможете сохранить общую массу.
А вообще рекомендую Вам почитать книжки , думаю они Вам многое поведают в часовом деле. Ведь часы это не просто набор шестерёнок, но и масса законов физики и математических расчётов.
Посоветую для начала первую часть книги Генриха Канна.
Скачать можно здесь
http://www.german242.com/books/books.htm